এ মন্ত্রণালয়ে যোগদানের আগে হাসানুজ্জামান ২৪ অক্টোবর ২০১৯ থেকে অতিরিক্ত সচিব হিসেবে কৃষি মন্ত্রণালয়ে কর্মরত ছিলেন। মো. হাসানুজ্জামান কল্লোল ১৯৯৩ সালে বিসিএস (প্রশাসন) ক্যাডারে সহকারী কমিশনার হিসেবে যোগ দেন। এরপর তিনি বরিশাল বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয় এবং ভোলা জেলা প্রশাসকের কার্যালয়ে ম্যাজিস্ট্রেট ও নেজারত ডেপুটি কালেক্টর হিসেবে দায়িত্ব পালন করেছেন। পরবর্তী সময়ে উপজেলা নির্বাহী অফিসার হিসেবে মানিকগঞ্জের দৌলতপুর ও টাঙ্গাইলের বাসাইল উপজেলায় দায়িত্ব পালন করেন।

তিনি বাংলাদেশ লোকপ্রশাসন প্রশিক্ষণ কেন্দ্র সাভারের উপপরিচালক ও রেক্টরের একান্ত সচিব এবং পরে জাতীয় সংসদের সংসদ উপনেতার একান্ত সচিব হিসেবে দায়িত্ব পালন করেছেন। পরে জেলা প্রশাসক হিসেবে রাজবাড়ী ও কুমিল্লা জেলায় সফলতার সঙ্গে দায়িত্ব পালন করেছেন। তিনি যুগ্ম সচিব হিসেবে গৃহায়ণ ও গণপূর্ত মন্ত্রণালয়ে কাজ করেন এবং পরে যুগ্ম সচিব ও অতিরিক্ত সচিব হিসেবে কৃষি মন্ত্রণালয়ে দায়িত্ব পালন করেন।